山东中医药大学附属医院、山东省中医院小儿推拿中心集医疗、教学、科研为一体的临床科室，在趵突泉院区、千佛山院区两个院区都设有门诊，在千佛山院区设有夜门诊。小儿推拿中心传承发展孙重三小儿推拿流派，该流派创始人孙重三老先生于上世纪60年代开展了中医小儿推拿治疗小儿疾病的临床研究和工作，开创了齐鲁小儿推拿流派——“孙重三小儿推拿流派”。小儿推拿中心现拥有山东省名中医专家2人，山东省中医院名医堂专家3人，博士生导师1人，硕士生导师3人，博士3人，在读博士2人，主任医师、教授6人，副主任医师、副教授1人，山东省中医院名医堂专家3人，主治医师8人，住院医师2人，技师1人。是山东省省级中医药临床重点专科，名老中医传承工作室1个，是山东省儿童青少年近视小儿推拿防控基地省级，山东省小儿推拿技能培训基地，山东省小儿推拿质量控制中心，中国中医药研究促进会全国小儿推拿教育培训基地，齐鲁医派孙重三小儿推拿流派传承工作室，山东孙重三小儿推拿流派“十三大手法”中医药特色技术示范门诊。专业理论基础雄厚，操作技能一流，科研能力和教学能力突出。是山东中医药大学小儿推拿博士研究生、硕士研究生培养基地，并承担本科生及临床规培、进修医师教学等任务。小儿推拿疗法，源远而流长，是传统中医外治疗法的一个重要分支，是祖国医学的重要组成部分。小儿推拿疗法具有绿色、安全、无毒副作用、无痛苦、疗效好等特点，被誉为最佳婴幼儿自然疗法。同时小儿推拿从整体观念出发，辨证推拿，通过调节患儿体质，提高抵抗力，对于疾病的预防保健及治疗均有其独特优势。在治疗方法上，小儿推拿中心在中医小儿推拿疗法基础上，开展了各种传统治疗方法，如拔罐、毫针、三棱针、头针、耳针、穴位贴敷、灸法、耳穴压豆等。可治疗病种达100余种，涵盖五官、呼吸、消化、神经、内分泌、泌尿、运动等系统，其中优势病种，主要有：近视、弱视、斜视、肌性斜颈、儿童生长发育迟缓、遗尿、感冒、发热、咳嗽、哮喘、腺样体肥大、鼻炎、小儿反复呼吸道感染、肠系膜淋巴结炎、腹泻、腹胀、腹痛、厌食、呕吐、流涎、夜啼、口疮、汗症、湿疹、脑瘫、面瘫等，另外，对疑难杂症，如自闭症、抽动-秽语综合征、肥胖、多动症、肢体畸形等也有很好的疗效。
小儿推拿中心作为山东省儿童青少年近视小儿推拿防控基地引进先进视力检查仪器，临床工作中注重传统手法和现代知识相结合，充分发挥中医小儿推拿治疗疾病无痛苦、无副作用、疗效佳的优势，于娟教授创立小儿推拿“四明穴”防治儿童青少年近视推拿技术，本技术经过几十年临床实践及病例观察，对儿童青少年近视、弱视鼻泪管阻塞不通、远视、斜视等视力减退疾病疗效显著，在山东省16地市二百余家基地推广普及。小儿推拿疗法是“以手代针”、“以手代药”、“以手代术”之术，在某些疾病治疗时，可以减少用药、输液和手术，减轻患儿痛苦，小儿推拿中心全体医务人员，将不断努力，为孩子的健康保驾护航。