全身活体组织病理检查：包括所有手术标本、身体各部位的穿刺组织标本（如肝组织、乳腺、肾组织、肺组织等）和纤维胃镜、肠镜、支气管镜、喉镜的活体标本，均可进行活体组织检查。

  薄层液基细胞学检查（TCT）：开展了妇科（宫颈阴道刮片）、非妇科（痰涂片、支气管刷片、胸腹水、尿液、甲状腺、乳腺囊液等各种组织穿刺液）的液基细胞学检查技术，细胞学自动阅片系统已运用于妇科TCT筛查，全部使用彩色图文报告。为健康普查和癌症的早期诊断提供可靠依据。

  术中冰冻切片检查：通过使用冰冻切片的方法，可在30分钟内发送病理报告，主要用于手术过程中的快速诊断，确定病变性质（如肿瘤或非肿瘤、良性肿瘤或恶性肿瘤），以决定手术方案和了解恶性肿瘤的扩散情况等。

  免疫组织化学检查：病理科有着成熟的免疫组织化学技术，现在常规开展近百项免疫组织化学检查项目，用于疾病的诊断和鉴别诊断，以及判断某些恶性肿瘤的转归和预后。

  特殊染色检查：如网状纤维染色、PAS及抗酸染色等，用于疾病的诊断和鉴别诊断。